Nacida en Sagunto, su padre (funcionario municipal) y su madre son de origen albaceteño. En su adolescencia se despertó su interés por la biología, durante sus estudios de bachillerato (1979) se decantó por la Licenciatura de Biología. Entró en la Universidad de Valencia para realizar sus estudios de Licenciatura de Biología en 1980.
Tras licenciarse y finalizar la especialidad de Bioquímica de la Licenciatura de Biología en 1985, se incorporó al Departamento de Bioquímica y Biología molecular de la Universidad de Valencia en 1986 con una beca FPI del Ministerio de Educación, Cultura y Deporte (MEC) para realizar su tesis doctoral en 1989 bajo la dirección de José Enrique Pérez merecedora del Premio Extraordinario de Doctorado. Tras ello inició una estancia postdoctoral de dos años en el laboratorio de Joseph Ecker en el Plant Science Institute de la Universidad de Pensilvania. En 1992 se reincorporó a su grupo de investigación de Biología molecular de Levaduras en el Departamento de Bioquímica y Biología Molecular de la UVEG, para posteriormente obtener una plaza como Profesora Titular en 1995 y luego la de catedrática en el año 2012.
Desde 1995, su investigación se ha centrado principalmente en el estudio de levaduras vínicas y la eficiencia tecnológica que presentan las mismas en sus diferentes usos industriales, desarrollando dicha actividad en instalaciones del Instituto de Agroquímica y Tecnología de Alimentos del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) en Valencia, de cuyo claustro científico es miembro. El desarrollo de dicha actividad científica con la colaboración de Agustín Aranda ha sido acompañada de financiación conjunta de grupos de excelencia de la Generalidad Valenciana. Su aporte científico se ve reflejado en los proyectos de I+D+i en los que ha participado, además de en las publicaciones científicas en las que Emilia ha participado, publicadas en revistas como Applied and Environmental Microbiology, Applied Microbiology and Biotechnology, Microbial Cell Factories o Biotechnology Journal. También ha participado como revisora de artículos científicos para las revistas: Journal of Agricultural and Food Chemistry, Biotechnology and Bioengineering, FEMS Yeast Research y Applied Microbiology and Biotechnology.
Ha realizado publicaciones científicas en revistas, capítulos de libros y comunicaciones en congresos nacionales e internacionales y también ha publicado artículos de divulgación científica en el periódico Levante. Además realiza divulgación a través de actividades de la Cátedra de Divulgación de la Ciencia de la Universidad de Valencia, entre las que se incluyen conferencias, la traducción de la biografía de Sydney Brenner y la participación como jurado de la XIII edición de los Premios Literarios de Divulgación de la Ciencia Ciutat de Alzira, desarrollado también actividad docente y de gestión universitaria.