Jennifer Doudna nació el 19 de febrero de 1964 en Estados Unidos. Jennifer Doudna siempre presentó un enorme e inquietante interés por la ciencia, ya que sus padres trabajaban como profesores y esta atmósfera académica despertó su curiosidad desde que era muy pequeña .
Se graduó en 1985 en Bioquímica por el Pomona College (California) y realizó su tesis doctoral sobre moléculas ARN en la Facultad de Medicina de la Universidad de Harvard, lo que la llevó a obtener su doctorado en Química Biológica y Farmacología Molecular en 1989 ( esto le abrió muchas puertas ).
Después de doctorarse, Jennifer Doudna trabajó como investigadora postdoctoral en el Hospital General de Massachusetts y en la Facultad de Medicina de Harvard.
En 1991 se fue de la Universidad de Colorado en Boulder para investigar con Thomas Cech. En 1994 estuvo trabajando como profesora en Yale, donde en 1996 completó un proyecto utilizando varias cosas que había aprendido con Cech en el pasado.
En el año 2000 promocionó a Yale mientras ella seguía siendo profesora de Harvard, esto duró hasta el año 2001. Al año siguiente, se fue a la Universidad de California como investigadora de Bioquímica y Biología Molecular.
En el año 2009 trabajó en Genentech, pero lo dejó rápidamente para centrarse en su investigación de los sistemas CRISPR-Cas junto otros científicos, pues era su prioridad en ese momento.
En 2017 dirigió el Instituto de Innovación Genómica en Berkeley.
Actualmente sigue siendo una figura líder en la investigación genética.